爱游戏颜宁等最新成果:AI助力解析胆固醇代谢之谜—新闻—科学网

时间:2023-10-27 23:53:41 已阅读:77次

北京时间6月29日,美国普林斯顿年夜学传授颜宁与清华年夜学助理传授闫创业研究组、西湖年夜学鄢仁鸿玻士等互助于《细胞陈诉》上揭晓了一项最新研究结果,进一步展现了胆固醇代谢的要害调控机理。

这项事情有两年夜亮点:第一是用AI技能辅助剖析中低分辩率的布局,第二是进一步相识了Scap卵白以及Insig卵白作为细胞内胆固醇感到器的事情机理。 颜宁告诉《中国科学报》。

人体怎样经由过程负反馈调治机制维持胆固醇的稳态?这是一个很是经典的科学问题。诺贝尔心理或者医学奖患上主Joseph Goldstein以及Michael Brown,于上世纪90年月鉴定出的胆固醇代谢调治机制 SREBP(Sterol Regulatory Element-Binding Protein)旌旗灯号通路饰演了很是主要的脚色。

Scap以及Insig是SREBP通路中的两个要害卵白,它们之间由胆固醇份子或者胆固醇衍生物介导的彼此作用,可以或许调控SREBP转录因子的活性,实此刻细胞内胆固醇含量降低时激活其摄入以及合成基因的表达,而于含量升高后按捺这一历程,从而实现负反馈调治模式。始终以出处在技能难度较高,这个通路的布局生物学研究进展相对于迟缓。

颜宁曾经笑言SREBP通路是本身的 初恋课题 :2001年她初到施一公传授试验室读玻,第一个课题即是针对于SREBP通路的布局生物学与生物化学研究;2005年做玻士后的第一个课题是SREBP通路中的膜卵白;于清华自力带领试验室以后的第一个科技部973工程也是针对于SREBP通路的布局生物学研究。

2021年1月,颜宁以及闫创业、鄢仁鸿等人于《科学》上揭晓一项主要研究,初次得到了跨膜区平����Ϸapp均分辩率约3.7埃的人源Scap与Insig-2卵白复合物的电镜布局,清楚到可以间接不雅测份子间彼此作用细节。他们还于于Scap以及Insig-2彼此作用界面上初次看到了具备主要功效的份子25-羟基胆固醇(25HC),倾覆了此前人们对于25HC 联合位点以及调控机理的认知。

这次揭晓的论文是上一篇论文的延续。 此前的研究报导,Scap以及Insig之间的彼此作用有两种路子,一种是由25HC介导,另外一种则是由胆固醇联合于胞外侧可溶区部门的loop1上来介导。 论文第一作者兼配合通信作者鄢仁鸿玻士对于《中国科学报》说, 上一篇揭晓在《科学》的论文已经经展现了由25HC介导的Scap以及Insig于跨膜区部门的作用细节,而本篇论文则是试图剖析Scap于胞外区Loop1以及Loop7的作用机制。

研究职员经由过程去垢剂筛选的要领进一步优化了Scap以及Insig的复合物样品,可以或许得到Scap的loop1以及loop7的中低分辩率密度图,但其实不足以搭建它的原子模子。怎样用相对于较低分辩率的图象做好布局剖析?研究职员接纳了腾讯公司开发的AI东西 tFold 来对于Scap卵白于胞外区的布局举行猜测,同时联合较低分辩率的电子密度图举行终极的布局模子搭建。 这项技能的上风是经由过程人工智能基在卵白质氨基酸序列特性,可以或许较好猜测出一个近似的布局模子,从而加速咱们对于卵白质布局的理解。 鄢仁鸿说。

本研究另有一个不测收成:研究职员用一种被称为 洋地黄皂苷 (digitonin) 的去垢剂将卵白质从细胞膜上抽提出来,却初次发明这类物资于布局上可以特同性地替换25HC,促成Scap以及Insig之间的彼此作用。这或者将为胆固醇调治新药研发提供一个潜于靶点。

胆固醇代谢与人类康健的重要杀手之一 心脑血管疾病互相关注。深切探究SREBP通路的份子机制可以或许加深咱们对于胆固醇调控的熟悉,有助在针对于性地开发降血脂药物,改良心脑血管疾病。 鄢仁鸿暗示, 今朝咱们已经经乐成剖析了Scap以及Insig复合物于胆固醇衍生物25HC份子介导下的布局,可是对于在Scap卵白受胆固醇份子调控的份子机制还没法注释,这些问题有待进一步研究。

论文链接:https://doi.org/10.1016/j.celrep.2021.109299

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